Rice Genome Database
Search         For         With        
Google
Scaffold027536 Oryza sativa spp. indica(9311) scaffold MapViewer
DESCRIPTION Scaffold027536 Oryza sativa spp. indica(9311) scaffold,2314 bp located in chromosome 5 from 626597to 628910
VERSION Scaffold027536.1
SOURCE Oryza sativa spp. indica(9311)
ORGANISM Oryza sativa
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta;Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae;
Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
FEATURES
  BGF GENES with 0 BGF predicted genes
  FgeneSH with 0 FgeneSH predicted genes
   mRNA   with 5 full length cDNA mapped
OsJRFA059322
MapViewer
  complement(join<628908...628189 >)
OsJRFA102800
MapViewer
  complement(join<628908...628059 >)
OsJRFA105623
MapViewer
  complement(join<628908...627864 >)
OsJRFA105930
MapViewer
  complement(join<628908...628190 >)
OsJRFA107650
MapViewer
  complement(join<628908...627288 >)
  repeat with 0 repeat regions
BASECOUNT A:655 C:540 G:530 T:589
ATCAGCTTAG  ATATTTTAAT  TTTCCATACG  ATTAACGTAA  TGATTTCTAG  
51  CTCTGAAAGC  AAACATGTCG  TTTTCTTCTG  ACCTTTGACC  TTGTTCTAAT  
101  AATATGCGTG  GCATATTGAT  TAATTGAGGA  GATGATGCAA  TTTAACTGAC  
151  AATTCCATCT  CACGAAAAGG  CCAGCCATGG  GCTGTCATTT  GAGATAGATG  
201  GGCATCTAAC  CTGTCATTAT  CCGTTAAGCA  GTGGGATTAC  TGATCGTTTC  
251  CATTACAGGG  ACGCGCACGA  GGCAGCCTGA  GAAAAGAGAA  GGAAGCTAAT  
301  GAAAACGAAA  GCGGCCAAGA  CCAAGAAAAC  GAGTCGACGG  TGATGCCGCG  
351  TTAGGTCGCT  CATCAACAGT  TGTCTCTCTT  TCCCTCCATT  TCTGGTCCAG  
401  CCATAAACAC  CATTAATACC  GTTTTTTTAT  CCTCTTTCCA  AAGGAAAATT  
451  TGCTCAATAC  TTGACTGAAG  TTAACATGAC  ATTGTTCATC  ACTCGTTTTC  
501  AGAAAAGAAA  ACAAAAAAAA  AAGAGAGGGG  ACATTATTCA  TCACTGTAGT  
551  GGTAGTGTGC  CTATAGGCAC  GTCACTGCTC  TCCAGGAACA  AAACGACACA  
601  ACCATTGTCT  CCTAATTCAG  CGTCTATTGG  GACCCAATGG  GAGCACAAGT  
651  AAAAACAGCC  ATTGGGGCTG  AGTGATGAGC  CATCAGAGAG  TAATTAATCG  
701  CACTTTGAAA  TTATTAGTTA  GTTTCTGTCA  CATGATGAGG  TGTGGCACCA  
751  AGATATTTTT  TGCTTGAGTG  ATCATATGGA  CTATAGAATG  GCCAAAGCTT  
801  CACAAATATC  TGTCCGTGTT  ATCGTCAGTT  CGTCACAAGA  AGCAAAAGAA  
851  CTACTAGGTC  GATCACCAAG  CCTGACGTGG  AATTGCAGCC  ATGACTTGGA  
901  AGGTTTCCAA  ATTCCAAGTT  GTGTGCTGTG  TCCTGGTCAA  AACAAACTAC  
951  AGTAGCACTT  GGCTTGTGTC  TCATATAGTC  ATCTCCTAGT  CCTTAAACTC  
1001  TGCATAACAA  CAAAGCTTTT  GCCACAAAAA  TTCTTGTTAT  CTCCATGAAT  
1051  TTCTTTCAAT  CTAAACCCAA  TCCACACGGC  AGACTTCAGT  GTTAATCAGA  
1101  GTTGGTCCTC  AGTCTCACCT  AAACCTATGA  TGCTAAGTCC  ATCTTTCCAA  
1151  GTGAAATGTA  GTGGTATGAT  TTGTCGATAG  AAAAATTATG  CTACTCCTGG  
1201  ATCTCACAAT  ATCACTGCAG  GTAGGAGCAC  AAGAGAAGGT  ACAGATCGCA  
1251  AGGACAACCA  TACAGCTACA  GGCAACAACA  GTCTTCATTT  TATCAGCCTG  
1301  AAGAAAAGAA  ACAATCTGAT  GCTGATGCCA  TCACGAACGA  ACGAAGGAAG  
1351  CCAATTACTA  GCAGTAACAA  TCCGGCTGTA  ACAGCCGGAC  GACGATGGAC  
1401  AGTGGCACTG  ACAGAGACAG  TGACACGCCA  CCACAGTTCA  AAGAACCGGT  
1451  ACACACTGGA  GTACGGTACA  TACAATGTCA  TCACATAGGC  AGAGACCGCA  
1501  GCTGCTGAAT  TCATGGCGAT  CCAATGGACC  ACCCTGCTGA  TGGCTGCAGC  
1551  ATCACCAGGA  CATGAACTCG  CACCATTATA  ACACGAGACA  AGGGCCAAAA  
1601  ATGGGGGCAT  GATTCATCAC  ACAGAGGAGG  AGGGGTCAGG  CCGGCGCAGA  
1651  GCTCACATGC  CATGGCAGGC  TAACTTTAGA  GGTGACGAAC  ATGAACCCCG  
1701  TTTCACATCT  CTGCTGCATG  CATCCCTTAA  CCACACCAAC  ACTCACTGTG  
1751  TGATTGATGA  TGAATTGCTC  TCACTCACTC  ACTCACTCTC  TCTCTGGTCT  
1801  TTCAGAGCTC  CTATGCATAT  GCTAAGCTTA  ACCCGGCAAG  CCGAAAAATA  
1851  GGGTGGGCAC  ACAGACAATG  GGGAGTGGAG  GGTTCTACTT  ATTTAGTCCC  
1901  TATCTATTTA  ACTTTCCATG  GATCAAAGTT  GCTCCAAATT  AGCCATTGGA  
1951  TTTTCATCTG  GGTTTCTGAT  ACCAACGGAT  GTTTTGAGGA  TGATGCGGCG  
2001  ATTGTCCGTG  CGTTGTTCTG  CTTTCATAGA  TCGTGCTCAG  GCTTGTCCAG  
2051  GTTGCTGCTG  TCACTGTCCG  CCATGCGGCT  CGAGCCACGG  CCAAGCTTTG  
2101  AGAAGGAGCC  CATGGCCGAA  GGTAGCCCTT  TGAAGCTGCT  GCTGCCCTCA  
2151  CTGAGGTTGT  GAGATCGACG  CGACCGCTTC  CGGGTGAGCT  GCAGGGATGA  
2201  CGGCTTGTCA  GGATCACAAG  CAGACCTTGT  TTGGGCCACC  ACCAGCCGTG  
2251  AGATGCTGCC  CCGGCAGAAT  GGGCAGGCCG  GTGAGGGCGG  TGTCAGGGTC  
2301  GTCGGATTGG  GTTT
    BGI Last Modified 28 Oct, 2008     Feedback_
    Supported by China National Grid Project 2002AA104250