Rice Genome Database
Search         For         With        
Google
Syngenta026419 Oryza sativa spp. japonica(Syngenta) scaffold MapViewer
DESCRIPTION Syngenta026419 Oryza sativa spp. japonica(Syngenta) scaffold,1676 bp located in chromosome 11 from 136909to 138584
VERSION Syngenta026419.1
SOURCE Oryza sativa spp. japonica(Syngenta)
ORGANISM Oryza sativa
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta;Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae;
Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
FEATURES
  BGF GENES with 0 BGF predicted genes
  FgeneSH with 0 FgeneSH predicted genes
   mRNA   with 0 full length cDNA mapped
  repeat with 2 repeat regions
Repeat232828 MapViewer
/repeat_start=227
/repeat_end=557
/repeat_family=Tourist-like
Repeat232829 MapViewer
/repeat_start=1085
/repeat_end=1676
/repeat_family=Gypsy-like
BASECOUNT A:564 C:343 G:283 T:486
1  TCAATTAATG  TACCTGCAGA  CATGGAAAAC  CCTTAACTTG  TTCACCTGTA  
51  AAGCGAGCGA  GCTAATTCAT  GGAATGTGTA  CTGCGTACTC  CAGCTATATA  
101  CTAGTAGCAT  GCATGTTGCT  AGACTGTGTC  AGTGTATACT  AGCTAGAGAT  
151  CCAGATCATC  CAGCCCATGC  ATGAACAGGT  TAAGATCTTG  AGTAATTTAT  
201  AAGTCCAGAT  GTACGTCTAA  TATTTAGGCT  TTATTTAGAT  TCAAACTTTT  
251  TTCTTCAAAC  TTTTAATTTT  TCCACGTCCA  TCAAATGTTT  GAACATATGC  
301  ATAAAGCCTT  AAAATTTGGA  CAAAAAAAAC  CAATCGCACA  GTTTGCATAT  
351  AAATCGCGAG  ACAAATTTTT  TAAGCTTAAT  TACACCATGA  TTTGACAATG  
401  TGGTGCTACA  GTAAATATTT  GCTAATGATA  GATTAATTAG  ACTTAATAGA  
451  TTCGTCTCGC  AGTTTATAAG  CGGAATTTAT  TATTAATTTA  TATTTAATAC  
501  TTCAAATGTG  TGTCCGTATA  CTTTAAAAAC  TTTACACCCA  AATAACTACA  
551  CACAACCAGA  ATTCGCTTGA  AATCGATCAG  CAGCGCGACT  CTTGCTAGGG  
601  AGACAAACTG  TTACCCAGTC  AGATGAGTGA  CAGTTCGAGA  GAGAGAGAGT  
651  CAGGCGCATG  GGATCAAAGG  AGTCTACTCG  GCCACTAGAG  CTAGTGTAGT  
701  ACTCCTTGAT  AATAATGCCA  TCATTATGTT  GATTACATTA  TGAAAGTCTG  
751  AAGTTACTCG  AATAATAGTA  ACTTTTAGCG  TCAAAAGTTT  ATCGATCCCA  
801  AAACATAACA  TAACTTCTCT  ATCTATTCCC  TCCTTTCAAC  AAATCACAGC  
851  CATCCCGGTT  AAATTTCTCC  ATGTACTTCC  TCATTTTAAG  TAATTCACGT  
901  ACCATCTCTA  ATTCTATTTC  ACATACTTTC  TTAATATAGT  CCGCAATCCA  
951  AAATAAACTA  TATTTAGAGA  CTTGGGAAGT  AGAAATTTTA  TTTGGCTACC  
1001  CAAGAGACAG  GCATACCAAG  TGCACGCTCA  TTACCTATAA  ATGGATTATG  
1051  ATAAACTTCT  GATTTGCTAA  TTTTCAGACT  ATTTTGTATA  TTAAATTTCT  
1101  GTCCAGGAAT  CAGCCAGGGT  ACACAAAACA  ATAAGTAAAT  ATACAGATCC  
1151  AAACGTAAAT  AAAGCGTAAA  ATACTTATAT  AAGAGGCACT  TAGTCCTCAC  
1201  ATCGAAATGA  AAGTAACAGC  AGCAGAAAAA  GGCGATCCTA  GCGAGGCTTC  
1251  AGCTCCACTC  CACAGACAAA  ACTCAACTGG  GGTCTGAGCC  TTGATCCTCT  
1301  AACTTCGTCT  TCAGCTCAGA  AGCTCTACAC  TTCTGAAAAG  AGGGAACAAT  
1351  AGCATGGCTG  AGTGCAACCA  CCATACTTAG  CAAGCCACAC  CAATGATGCA  
1401  CTCATGCAAT  GGGGCACAAA  GGGAGGTTTG  TGGCTATTTG  CATAAAGACA  
1451  GTTGTAAAGC  ATTTATAGTT  GAAAACGGTA  AAACAGTTGT  TTAATTAAGG  
1501  TAATATTAAA  TCTCCACTGA  TCAACGCTAC  ACCACGTTGA  ACAGACCCAA  
1551  CCAAACCACC  TGAATTACAC  TAGTTCATTA  ACCAATTATT  AAGGATGGGA  
1601  CTAATCACGG  TGAATCTGGT  CGATCACCCA  TAACCAGCAC  GGCTATTCAA  
1651  ATAGTTTTAC  TCTGGCCAGA  GGTGCA
    BGI Last Modified 28 Oct, 2008     Feedback_
    Supported by China National Grid Project 2002AA104250